Atlas vino de atrás para forzar un empate 1-1 en los 90 minutosreglamentarios y despuésvenció 5-4 (global 6-5) en tanda de penalespara conseguir su pase a la final de la Copa MX Apertura 2013, donde enfrentará a Morelia.
El paraguayo Gustavo Adrián Ramírez marcó el tanto del cuadro oaxaqueño a los 33 minutos, pero Flavio Santos, en el 46, anotó por Rojinegros en los 90 minutos reglamentarios. El arquero chileno Miguel Angel Pinto fue figura de los tapatíos al detenerle a José Medina el cuarto disparo, en una tanda que tuvo nueve aciertos.
Con ello, por segunda edición consecutiva la final la disputarán dos conjuntos de la Liga MX, luego que Cruz Azul venció al Atlante en el Clausura 2013.